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labdaps/labskills

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labskills

Skills do Claude Code para o LABDAPS (Laboratório de Big Data e Análise Preditiva em Saúde, FSP-USP). Repositório colaborativo e aberto: estudantes e professores adicionam, melhoram e compartilham skills que ajudam no fluxo de trabalho do laboratório, de modelagem preditiva em saúde até escrita e submissão de artigos.

O que é uma skill

Uma skill é um conjunto de instruções em Markdown que o Claude Code carrega sob demanda para executar uma tarefa especializada. Cada skill vive em skills/<nome>/SKILL.md, com um cabeçalho YAML (name, description) que define quando ela é acionada. Saiba mais em docs.claude.com/claude-code.

Skills disponíveis

DataSUS e pipeline do laboratório

Skill O que faz
datasus-outcome Adiciona um novo desfecho preditivo ao pipeline datasus-ai-prediction: subclasse de OutcomeConfig, registro e checklist anti-leakage.

Ciência de dados e ML

Skill O que faz
ml-pipeline Pipeline padrão de ML para projetos de saúde, alinhado às convenções do datasus-ai-prediction (train_cv, OOF probs, calibração, janelas temporais).
ml-eval-report Relatório de avaliação reusando core/models/evaluation.py: ROC, PR, calibração, SHAP, métricas por subgrupo e comparação entre estados/períodos.
ml-timeseries Setup de modelos de séries temporais em saúde (skforecast, ARIMA, LSTM, Prophet).

Pesquisa e escrita científica

Skill O que faz
paper-review Leitura crítica estruturada de artigo externo: resumo, metodologia, pontos fortes e fracos.
peer-review Simula revisão por pares do seu próprio manuscrito antes de submeter: nota 1-5 por dimensão (Abstract, Métodos, Resultados, etc.), lista de revisões prioritárias e decisão editorial (Aceito / Revisões menores / Revisões maiores / Rejeitar).
paper-scaffold Estrutura de artigo com seções, checklist e template LaTeX/Markdown.
artigo Pipeline em 7 fases de escrita de artigo em IA médica com reporting guidelines (TRIPOD+AI, STROBE, PRISMA, CONSORT, STARD).
radar-academico Busca semanal de papers por tema, filtra, baixa PDFs e resume.
update-paper Atualiza seções de resultados em LaTeX quando análises ou métricas mudam.

Como usar

Instalação rápida (todas as skills)

git clone https://github.com/labdaps/labskills.git
cd labskills
./install.sh

O script copia as skills para ~/.claude/skills/, deixando-as disponíveis em qualquer projeto do Claude Code.

Instalar uma skill específica

cp -r skills/peer-review ~/.claude/skills/

Depois é só acionar no Claude Code: /peer-review ou pedir em linguagem natural ("faz peer review do meu manuscrito", "revisa meu artigo como revisor de journal").

Como contribuir

Toda contribuição é bem-vinda. Veja CONTRIBUTING.md para o guia completo de como criar, testar e abrir PR de uma skill nova.

Licença

MIT. Use, adapte e compartilhe.

About

Repositorio colaborativo de skills do Claude Code para o LABDAPS: ML em saude e escrita cientifica. Estudantes e professores contribuem.

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